داستان بازی Ace Combat 7: Skies Unknown در دنیایی خیالی به نام Strangereal جریان دارد و درباره جنگی بین دو کشور بزرگ یعنی Osea و Erusea است.
شما در نقش یک خلبان به نام Trigger وارد جنگ می‌شوید، اما به اشتباه متهم شده و به واحدی از خلبانان تبعیدی فرستاده می‌شوید. در ادامه با مهارت‌های خود دوباره به ارتش بازمی‌گردید و در نبردهای هوایی سرنوشت‌ساز شرکت می‌کنید.
در طول بازی، جنگ به دلیل استفاده گسترده از پهپادها و هوش مصنوعی پیچیده‌تر می‌شود و در نهایت کنترل آسمان و آینده جنگ به تصمیم‌ها و مهارت‌های شما بستگی دارد.
در مجموع، داستان بازی درباره جنگ مدرن، خیانت، رستگاری و نبرد انسان با تکنولوژی در آسمان است.